Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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