Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vstm2lQ6PDS0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms