Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chd4Q6PDQ2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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