Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp49Q6P9L4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms