Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms