Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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PtprdQ64487 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprdQ64487 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprdQ64487 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprdQ64487 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprdQ64487 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprdQ64487 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprdQ64487 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprdQ64487 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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