Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtmQ62388 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AtmQ62388 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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