Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall3Q62255 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms