Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms