Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbbp4Q60972 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms