Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms