Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tdrd5Q5VCS6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tdrd5Q5VCS6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms