Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms