Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trp53i11Q4QQM4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms