Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5460Q3UQ97 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms