Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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