Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CrxosQ3UL53 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms