Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shcbp1lQ3TTP0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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