Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms