Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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