Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3ip1Q149C2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms