Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Itgb8Q0VBD0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Itgb8Q0VBD0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Itgb8Q0VBD0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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