Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vps8Q0P5W1 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms