Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms