Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gjb5Q02739 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms