Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
GscQ02591 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
GscQ02591 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GscQ02591 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
GscQ02591 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
GscQ02591 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GscQ02591 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms