Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms