Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top2aQ01320 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms