Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms