Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

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Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smarcc1P97496 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Smarcc1P97496 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcc1P97496 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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