Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mesp1P97309 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mesp1P97309 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms