Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms