Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TgfbiP82198 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.4 ms