Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms