Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Irx1P81068 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms