Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SbdsP70122 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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