Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rps3P62908 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms