Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms