Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samsn1P57725 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samsn1P57725 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms