Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp25P57080 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp25P57080 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms