Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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