Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CdaP56389 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CdaP56389 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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