Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms