Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VdrP48281 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms