Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Epb41P48193 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms