Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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