Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc11P31313 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms