Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxa2P31245 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms