Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd10P28359 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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