Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gjb1P28230 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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